前面提到網(wǎng)站結(jié)構(gòu)優(yōu)化要解決的最重要的問題包括收錄及頁面權(quán)重分配。在理想情況下，經(jīng)典樹形結(jié)構(gòu)應(yīng)該是比較好的鏈接及權(quán)重分配模式。但是由于不同網(wǎng)站采取技術(shù)不同，要實現(xiàn)的功能、網(wǎng)站目標、重要解決的營銷問題都很可能不同，某些看似是樹形結(jié)構(gòu)的網(wǎng)站，仔細研究起來其實奇形怪狀。每個網(wǎng)站都有自己特殊的問題需要解決，沒有可以適用于所有網(wǎng)站的結(jié)構(gòu)優(yōu)化秘訣，必須具體問題具體分析。
1.重點內(nèi)容
  首先考慮一個最簡單最常見的問題。一般來首，網(wǎng)站首頁獲得的內(nèi)外部鏈接最多，權(quán)重最高。首頁鏈接到一級分類頁面，這些一級分類頁面權(quán)重僅次于首頁。大部分網(wǎng)站有多層分類，權(quán)重一次下降，權(quán)重最低的是最終的產(chǎn)品頁面。
2.非必要頁面
每個網(wǎng)站都有一些在功能及用戶提樣方面很必要、但在SEO角度沒必要的頁面，比如隱私權(quán)策略、用戶登陸頁面、用戶注冊頁面。從用戶角度看，這些頁面時必須的功能或有助于提高網(wǎng)站信任度。不過搜索引擎既不能填表，也不登陸，這些頁面既沒有必要也不太可能獲得任何排名。
 3.大二級分類
     典型樹形結(jié)構(gòu)首頁鏈接到一級分類，一級分類再列出二級分類，這樣，只要二級分類數(shù)目不要相差太大，權(quán)重值在二級分類頁面上是大致平均分配的。不過有些時候某些二級分類下的產(chǎn)品數(shù)遠遠多一些其他小一些的二級分類，甚至產(chǎn)品太多的二級分類下還可能再列三級分類。平均分配權(quán)重的結(jié)果就是，小分類充分收錄，產(chǎn)品數(shù)量大的分類有很多產(chǎn)品頁面因為權(quán)重稀釋無法收錄。
  4.翻頁過多
     稍大型的商務(wù)或信息類網(wǎng)站都可能會在產(chǎn)品列表。也就是最末一級的分類頁面上，存在翻頁過多的問題。通常產(chǎn)品列表會顯示10個或20個產(chǎn)品，然后列出翻頁鏈接，除了“上一頁”和“下一頁”，網(wǎng)站可能列出5個、10個翻頁鏈接。用戶點擊頁面10，第10頁上又會列出10~19的翻頁。
5.單一入口還是多入口
 一般來說，網(wǎng)站首頁和分類頁面收錄不會有上面問題，除非主導航系統(tǒng)有嚴重蜘蛛陷阱，或者網(wǎng)站已經(jīng)被處罰。大部分網(wǎng)站在結(jié)構(gòu)方面面對挑戰(zhàn)，是使更多最終產(chǎn)品頁面被收錄。就算盡量吧網(wǎng)站結(jié)構(gòu)扁平化，當產(chǎn)品數(shù)量巨大時，實際上已經(jīng)不太可能足夠扁平。在這種情況下，要讓最終產(chǎn)品頁面被收錄。有兩個策略：一是多入口，而是單一入口。在選擇上學喲啊謹慎。
6.相關(guān)產(chǎn)品鏈接
無論單一入口還是多入口結(jié)構(gòu)，對最終產(chǎn)品頁面來說都有一個缺陷，那就是太過規(guī)則。有時候回造成某個部分的產(chǎn)品頁面不能被收錄。單一入口的結(jié)構(gòu)更明顯。比如如果某個分類頁面因為導航設(shè)計不合理，離首頁太遠沒有被收錄，這個分類下的所有產(chǎn)品就都無法被收錄。再比如博客系統(tǒng)中，發(fā)表比較早的帖子，無論從哪個入口渠道來看，都會被推到網(wǎng)站更深層，離首頁比較遠。，老帖子雖然一般沒有收錄問題（早被收錄了），但權(quán)重卻隨時間的推移而下降。
7.錨文字分布及變化
前面提到過，合理的網(wǎng)站結(jié)構(gòu)是在網(wǎng)站中分配錨文字的重要方法之一。最常見靈活的是在頁面正文中或人工或自動加上其他頁面的內(nèi)部鏈接，鏈接錨文字可以有各種選擇。這方面的應(yīng)用學習目標非維基百科莫屬。